По собственному утверждению Бакатина, пришел он на пост Председателя КГБ с задачей «реформировать организацию», а точнее — разрушить органы государственной безопасности, как он сам пишет в своей книге «Избавление от КГБ». 5 декабря 1991 г. передал послу США в СССР Ричарду Страуссу техническую документацию, относящуюся к установке и использованию сверхсекретных подслушивающих устройств в новом здании посольства США в Москве.
За раскрытия «секретов КГБ», во время работы на своём посту Бакатин (как и министр иностранных дел РФ Козырев) получил высокооплачиваемую должность в совете директоров иностранной компании - в британской Baring Vostok Capital Partners.